小琉球每年吸引大量遊客前往，多數遊客皆搭乘船隻往返東港碼頭及小琉球碼頭。然而，小琉球航線易受天候影響，尤其在東北季風期間，經常發生停航或延航的情況。22日就因海象不佳緊急停航，導致許多欲返航的遊客滯留小琉球碼頭。碼頭一度擠滿人潮，場面十分混亂。而東琉、鹽琉線各船運公司也宣布，海象惡劣今23日全天停航。

屏東縣小琉球是著名的離島旅遊勝地，每逢假日就會湧入大量遊客。根據統計，6月14日登島人數為5111人，而6月15日更是突破萬人，達到10418人。然而，在15日晚間7時30分左右，小琉球突然發生全島大停電，共有4171戶住家受到影響。

屏東縣政府繼公告島上5處潮間帶劃設為自然人文生態景觀區後，除限制管控同時間進入人數外，並自7月1日起收取每名遊客60元海洋保育費

疫情趨於平緩加上暑假旺季將至，東琉線業者自6月27日起將陸續恢復正常航班，增班後東琉線每日增加近2000人次運能、鹽琉線每日增加近300人次運能。